Постоје две врсте флуоресцентних микроскопа на основу њиховог оптичког пута:
1. Трансмисиони флуоресцентни микроскоп: Ексцитациони извор светлости се преноси кроз материјал узорка кроз кондензатор да би побудио флуоресценцију. Уобичајени колектори светлости тамног поља, или обични колектори светлости, могу се користити за подешавање рефлектора за претварање побудне светлости и бочне светлости на узорак. Ово је релативно старомодан флуоресцентни микроскоп. Његова предност је што је флуоресценција јака при малом увећању, док је недостатак што флуоресценција слаби са повећањем увећања. Због тога је боље посматрати веће материјале узорака.
2. Флуоресценцијски микроскоп са падајућим снопом Ово је нова врста флуоресцентног микроскопа развијена у модерним временима. За разлику од претходног, побудна светлост пада са сочива објектива на површину узорка, користећи исто сочиво објектива као кондензатор осветљења и сочиво објектива за прикупљање флуоресценције. Двобојни сепаратор снопа треба додати на оптичку путању, која је под углом од 45 степени у односу на лагани уранијум. Побуђена светлост се рефлектује у сочиво објектива и концентрише на узорак. Флуоресценција коју генерише узорак, као и побудна светлост која се рефлектује од површине сочива објектива и покривног стакла, истовремено улазе у сочиво објектива и враћају се у сепаратор дихроичног снопа, раздвајајући ексцитацију и флуоресценцију. Преостало узбуђење тада апсорбује филтер за блокирање. Ако се користе различити филтери за побуђивање/двобојни сепаратори зрака/комбинације филтера за блокирање, они могу задовољити потребе различитих флуоресцентних реакционих производа. Предност овог флуоресцентног микроскопа је у томе што је видно поље уједначено, слика је јасна, а што је веће увећање, то је флуоресценција јача.
（2） Употреба флуоресцентног микроскопа
1. Укључите извор светлости и живину лампу ултра високог притиска треба претходно загрејати неколико минута да би достигла свој врхунац.
2. Трансмисиони флуоресцентни микроскоп захтева да се између извора лампе и кондензатора инсталира потребан филтер за побуђивање и да се одговарајући филтер за блокирање постави иза сочива објектива. Флуоресценцијски микроскоп са падајућим снопом треба да убаци потребни филтер за узбуђење/двобојни сепаратор зрака/блок филтера за блокирање у прорез оптичке путање.
3. Посматрајте микроскопом мале снаге и подесите центар извора светлости према уређајима за подешавање различитих модела флуоресцентних микроскопа, тако да се налази у центру целе тачке осветљења.
4. Поставите кришке узорка и фокусирајте их да посматрате. Током употребе, треба напоменути да завршни филтер не треба директно посматрати очима како би се избегло оштећење ока; Када се узорци посматрају уљним микроскопом, мора се користити посебан нефлуоресцентни микроскоп за уље; Након што се живина лампа високог притиска искључи, не може се одмах поново укључити. Потребно је 5 минута да се поново покрене, иначе ће бити нестабилан и утицати на животни век живине лампе.
(3) Посматрајући под флуоресцентним микроскопом на платформи за учење помоћу филтера за плаво љубичасто светло, може се видети да су ћелије обојене 0.01 процентом акридин наранџасте флуоресцентне боје, језгро и цитоплазма стимулисани да производе две различите боје флуоресценције (тамно зелена и наранџасто црвена).
