Које су предности двофотонске флуоресцентне микроскопије
1) Светлост дугих таласа је мање под утицајем расејања од светлости кратког таласа и лако продире у узорак;
2) Флуоресцентни молекули изван фокалне равни нису побуђени, тако да више ексцитационе светлости може доћи до фокалне равни, тако да побудна светлост може продрети у дубље узорке;
3) Блиско инфрацрвено светло дугих таласа је мање токсично за ћелије од светлости кратких таласа;
4) Приликом посматрања узорака двофотонским микроскопом, фотоизбељивање и фототоксичност се јављају само у фокалној равни. Због тога је двофотонска микроскопија погоднија од једнофотонске микроскопије за посматрање дебелих узорака, за посматрање живих ћелија или за експерименте фотобељења на месту.
