Предности вишефотонске ласерске скенирајуће микроскопије: кратак преглед
1. Побуђен црвеном или инфрацрвеном светлошћу, расејање светлости је мало, а расејање малих честица је обрнуто пропорционално четвртом степену таласне дужине.
2. Више расејаних фотона са попречног пресека слике може се прикупити без потребе за рупицама.
3. Рупице не могу да разликују расуте фотоне емитоване из дефокусираних или фокалних области, а вишефотони имају бољи однос сигнал-шум у дубокој слици.
4. Ултраљубичасто или видљиво светло које се користи за једнофотонско побуђивање лако се апсорбује и слаби од стране узорка пре него што сноп стигне до фокалне равни, што отежава побуђивање дубоких слојева.
5. У погледу посматрања биолошке микроскопије, прво треба да се узме у обзир да се не оштети активно стање самог организма, одржава циркулација воде, концентрација јона, кисеоника и хранљивих материја. У области посматрања светлости, и топлотна и фотонска енергија морају остати унутар дозе зрачења и светлосне енергије које не оштећују ћелије.
6. Мултифотонска микроскопија има много предности. У погледу тродимензионалне резолуције, инвазије дубине, ефикасности расејања, позадинског светла, односа сигнал-шум, контроле, итд., постоје карактеристике које претходни ласерски микроскопи не поседују или не могу да надмаше
Недостаци вишефотонског ласерског скенирајућег микроскопа:
1. Само за флуоресцентно снимање.
2. Ако узорак садржи хромофоре који могу да апсорбују ексцитационо светло, узорак може бити подвргнут термичком оштећењу.
3. Резолуција је мало смањена, иако се може побољшати истовременом употребом конфокалних малих рупа, постоји губитак сигнала.
4. Због ограничења скупих ултрабрзих ласера, цена вишефотонских микроскопа за скенирање је релативно висока.
